Mardin Artuklu Üniversitesi Tıp Fakültesi Dekanlık ve Morfoloji Binası, yine üniversitemiz Rektörlük binasının da bulunduğu Diyarbakır Yolu üzerindeki yerleşkede yer almaktadır. Geçici süreyle kullanımı hedeflenen mevcut binamız zemin artı iki katlı olup fakülte binası içerisinde Dekanlık, Öğretim Üyeleri Odaları, Derslikler ve laboratuvarlar yer almaktadır.

Hali hazırda yapımı tamamlanan Anatomi Disseksiyon Laboratuvarı, Anatomi Maket Laboratuvarı, Anatomi Kadavra Odası birimlerinden oluşan Anatomi Laboratuvarı, 30 adet ışık mikroskobu ve eğitmen mikroskobu ile eş zamanlı görüntü inceleme yapılmasına olanak sağlayan Mikroskopi Laboratuvarı, genel laboratuvar uygulamaları ile biyokimyasal ve mikrobiyolojik uygulamaların gerçekleştirilebileceği Multidisipliner Öğrenci Laboratuvarı, genel eğitim ve araştırma faaliyetlerinin yapılabileceği çok amaçlı Çözelti Hazırlama Laboratuvarı, klinik öncesi uygulamaların yapılabilesi amacıyla eğitim-öğretim faaliyetlerinin yürütülebileceği ayrıca hasta senaryolarının uygulanarak gözlenebileceği Simule Hasta ve Maket Laboratuvarı ile Mesleki Beceri Laboratuvarı ünitelerini barındırmaktadır. Fakülte binamızda ve Rektörlük ana bina bünyesinde DönemI, Dönem II ve Dönem III öğrencilerin teorik eğitim faaliyetlerinin yürütülmesi amacıyla 50'şer kişi kapasiteli üç adet derslik ve üç adet Probleme Dayalı Öğrenim (PDÖ) sınıfı, fakültemize ait ve her alt banştan geniş bir tıbbi kaynak altyapısına sahip olan, öğrencilerimizin günün her saati erişim sağlayabileceği, hem ders çalışma hem de okuma faaliyetlerini gerçekleştirebilecekleri Uzm. Dr. Rıdvan Üney CTF93 Öğrenci Kütüphanesi bulunmaktadır. Fakültemiz Dekanlık katında tıp tarihine ve insan tıbbının geçirdiği gelişime ışık tutan cerrahi maalzemelerin ve eğitici/tarihsel materyallerin sunulduğu mini bir Tıp Tarihi Vitrini bulunmaktadır. Sunulan materyal arşivinin genişletilmesi ve bir müze haline dönüştürülmesi hedeflenmektedi.

Fakülte binamızın kendisine ait otoparkı, asansör ile taşıma altyapısı bulunmakta olup bütün katlarda erkek ve kadın lavaboları, bir adet ibadethane, büfe gibi bütün ihtiyaçların karşılanabilmesine yönelik yeterli altyapı ve donanımı bulunmaktadır. Gerek üniversitemiz gerek diğer kamu kurum ve kuruluşlar ile hayırsever Mardin halkının destekleri ile fakültemiz çevresinde iyileştirme faaliyetleri yapılmış ve kullanım alanının verimini arttırma, sosyal alanların genişletilmesi, öğrencilerimiz ve fakültemiz personelinin güven ve mutluluk içerisinde bulunabileceği bir ortam oluşturulmasına yönelik geliştirme faaliyetleri devam etmektedir. Fakültemizde aktif olarak kullanılan tek bir ana giriş kapısı bulunmakta olup 24 saat güvenlik görevlileri yer almakta ayrıca fakültemizin iç ünitelerinin tamamı güvenlik kameraları ile kayıt altına alınmaktadır.