Esas olan bir kitabın basılması değildir;  içeriği itibariyle kaliteli kitapların basılmasıdır. MAÜ Yayınları, genellikle teoride kalan bu klasik söylemi pratikte de uygulamayı amaçlamaktadır. Buna göre, yayımlanacak kitapların, önce yayın komisyonunun ön incelemesinden, ardından da farklı alanlarda uzman hakemlerin onayından geçmesi beklenmektedir.

MAÜ Yayınları, bilimsel açıdan farklı alanları ifade eden serilere önem vermektedir. Bu doğrultuda, basılması planlanan eserleri, “Dinler Tarihi Araştırmaları Serisi”, “Kent Çalışmaları Serisi” veya “Süryaniyat Araştırmaları Serisi” örneklerinde görüldüğü üzere ait olduğu kategoriyi esas alan bir serinin parçası olarak yayımlamaktadır.

MAÜ Yayınları, yeni yeni ivme kazanmaya başlayan yayıncılık hayatında, seçkin yapıtları okurlara sunmaya, geniş bir bilim yelpazesi içinde farklı alanlardan kitaplara hayat vermeye namzettir; bunun meşakkatli bir uğraş olduğunun ve sorumluluk istediğinin farkındadır.