Mardin Artuklu Üniversitesi Döner Sermeye İşletme Müdürlüğü 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu 58. maddesi çerçevesinde 27.01.2012 tarih ve 28186 sayılı Resmi Gazete’ de yayımlanan “Mardin Artuklu Döner Sermeye İşletmesi Yönetmeliği” ile birlikte Maliye Bakanlığıyla gerekli yazışmalar yapıldıktan sonra resmen faaliyetine başlamıştır. 23.11.2022 tarih ve 32022 sayılı Resmi Gazete’ de yayımlanan ek yönetmelik ile faaliyetlerini sürdürmektedir.
Döner Sermaye İşletmesinin Yönetim Kurulu, Üniversitenin Yönetim Kuruludur. Üniversitemiz Döner Sermaye Saymanlık görevi Mardin Defterdarlığı Muhasebe Müdürlüğü tarafından yürütülmektedir.